Nakon što slučajno ozlijedi farmera Hoggetta pa ovaj nije sposoban plaćati račune, Babe odlazi u veliki grad kako bi pokazao svoj pastirski talent i zaradio dovoljno novca da spasi farmu.
Elitna postrojba G.I. Joe u ovom se nastavku bori protiv svojih starih neprijatelja, organizacije Cobra, ali se moraju suočiti i s prijetnjama iz vlade koje bi mogle ugroziti samo njihovo postojanje...
