"Tišina" prati Rodriguesa i Garupea, dvojicu svećenika koji odlaze u Japan kako bi pronašli voljenog mentora koji se navodno odrekao Boga i kršćanstva. Iako se u Japanu odvija progon kršćana oni ne žele odustati od misije jer su uvjereni da je njihova vjera jača od ičega.
U srcu južnoameričke džungle, isusovački misionari suočavaju se s okrutnom stvarnošću kolonijalne moći. Njihov pokušaj da zaštite domorodačko pleme Guarani od ropstva sukobljava se s interesima španjolskih i portugalskih kolonista. Bivši plaćenik, sada svećenik, i karizmatični vođa...