Kornjače se vraćaju u borbu protiv zlikovaca sa svojim novim saveznikom Caseyjem Jonesom. Braća kreću u lov na odbjeglog superzlikovca Shreddera, ali u tom procesu nailaze na još veću prijetnju: Kranga.
Zli čarobnjak Shao-Kahn (Brian Thompson) otvorio je portale između svoje paklene dimenzije i Zemlje. Svijet će biti uništen za šest dana, osim ako skupina od pet heroja - Liu Kang (Robin Shou), Kitana (Talisa Soto), Jax (Lynn "Red" Williams), Sonya Blade (Sandra Hess) i Rayden (James Remar),...
Kako bi izbjegao zatvorsku kaznu, Joe Armstrong (Michael Dudikoff) prihvati sudsku nagodbu i odlazi u američku vojnu bazu na Filipinima. Za jedne od prvih misija napada ga skupina pobunjenih ninja koju predvodi opasni trgovac oružjem Ortega, čija je namjera ukrasti zalihe oružja američke...
