Radnja filma ponovno se vrti oko multimilijardera Tonyja Starka (Downey Jr.) koji se suočava sa sve većim pritiskom vlade, javnosti i novinara koji ga pokušavaju natjerati da podijeli svoju tehnologiju s vojskom što on nikako ne želi učiniti, jer se boji da bi ista mogla pasti u krive ruke....
Na Dan nezavisnosti, djed (Leslie Nielsen) priča djeci priču o Michaelu Maloneu (Kevin P. Farley). Malone ne voli Dan nezavisnosti i odbija ga slaviti sa svojim nećakom Joshom (Travis Schuldt), koji uskoro odlazi na zadatak na Srednji istok. Te noći Michael doživi viziju svog heroja Johna F....
Godina je 1961. Arka, svemirski brod s planeta Cybertron, koji krije tajnu koja bi mogla okončati rat između Autobota i Decepticona, sruši se na tamnu stranu Mjeseca. NASA uoči nesreću nakon čega John F. Kennedy odobri misiju na Mjesec s tajnim zadatkom da se istraži svemirski brod. Godine...
