Sadie, Noah i Dudley, dva brata i sestra, uvučeni su u najveću avanturu njihovih života kada nehotice otkriju ulaz u drevni hram u kojem se navodno skriva zapanjujuće blago. Ali, da bi došli do blaga i pronašli izlaz moraju izbeći niz ubojitih zamki.
Prošlo je nekoliko mjeseci otkako su mutanti zaustavili Williama Strykera, ali su to platili gubitkom Jean Gray, s čime se Scott nikako ne može pomiriti. Odlazi na mjesto na kojem ju je izgubio i ona se pojavi pred njim. Sukobi ljudi i mutanata, koji dosežu kritičnu točku, mogli bi uskoro...
Nakon međusobne borbe u prvom filmu, mutantski neprijatelji profesor Xavier i Magneto moraju se udružiti da nađu mutanta ubojicu koji je pokušao smaknuti predsjednika dok Mutantsku akademiju napadaju oružane snage.
