"Tišina" prati Rodriguesa i Garupea, dvojicu svećenika koji odlaze u Japan kako bi pronašli voljenog mentora koji se navodno odrekao Boga i kršćanstva. Iako se u Japanu odvija progon kršćana oni ne žele odustati od misije jer su uvjereni da je njihova vjera jača od ičega.
Nakon neuspješne pljačke ljekarne, policija privodi narkomanku Nikitu (Anne Parillaud). Premda je osudi na smrtnu kaznu policija lažira njenu smrt i odluči joj pružiti još jednu priliku, da za protuobavještajnu službu uklanja nepoželjne ljude.
Jon Aldrich (T. Selleck) živi u Chicagu, ima ženu (W. Crewson) koju voli i dvoje djece, zarađuje dobro, živi u pristojnoj kući. Kad dobije poziv od majke (A. Jackson) da je ona u bolnici zbog bubrežnih kamenaca, a da je otac (D. Ameche) ostao sam kod kuće, ne sluti da će mu se cijeli život...