"Tišina" prati Rodriguesa i Garupea, dvojicu svećenika koji odlaze u Japan kako bi pronašli voljenog mentora koji se navodno odrekao Boga i kršćanstva. Iako se u Japanu odvija progon kršćana oni ne žele odustati od misije jer su uvjereni da je njihova vjera jača od ičega.
Ranjeni konfederacijski vojnik dezertira iz svoje jedinice i putuje preko juga, nastojeći se vratiti mladoj supruzi koju je ostavio da pazi na njihovu farmu.
Radnja se odvija u izoliranoj benediktinskoj opatiji u 14. stoljeću, gdje niz misterioznih smrti uznemiruje redovnike. Franjevački redovnik William od Baskervillea i njegov mladi učenik Adso dolaze u opatiju kako bi istražili te smrti, koje se isprva čine kao slučajni događaji, ali ubrzo...