Bivši operativac CIA-e vraća se u akciju kada se pojavi tajanstvena žena iz njegove prošlosti. Razotkriven i progonjen od strane nemilosrdnog ubojice i odmetnutog programa crnih operacija, mora se osloniti na vještine za koje je mislio da ih je ostavio iza sebe.
IMF je ukinut kada ga okrive za globalnu terorističku bombašku urotu. Pokrenut je „Protokol duh“, a Ethan Hunt i njegov odmetnuti novi tim moraju ući u ilegalu i bez ičije pomoći i kontakata očistiti ljagu s imena svoje organizacije.