Kad Allison, djevojka popularnog srednjoškolskog sportaša Berkea, prekine njihovu vezu, on napušta sport i pridružuje se školskom mjuziklu u pokušaju da je ponovno osvoji, ali ubrzo shvaća da ima osjećaje prema drugoj djevojci.
Najslavniji lik iz svijeta X-Mena, Logan, stoljeće star mutant u svijetu poznat kao Wolverine, namamljen je u Japan kamo nije kročio od 2. svjetskog rata – i u sjenovito carstvo Yakuza i samuraja.
Dva mutanta, Rogue i Wolverine, dolaze u privatnu akademiju za svoju vrstu čiji se rezidentni superherojski tim, X-Men, mora suprotstaviti terorističkoj organizaciji sa sličnim moćima.
Prošlo je nekoliko mjeseci otkako su mutanti zaustavili Williama Strykera, ali su to platili gubitkom Jean Gray, s čime se Scott nikako ne može pomiriti. Odlazi na mjesto na kojem ju je izgubio i ona se pojavi pred njim. Sukobi ljudi i mutanata, koji dosežu kritičnu točku, mogli bi uskoro...
